以下が浮かびました。

①1インポートセットに対し対象テーブル分変換マップを作成する
　→CIテーブル用の変換マップと、資産テーブル用の変換マップを作成する
　　Excelファイルのロード後、2つの変換マップを選択し、実行する
　　懸念点：それぞれの変換マップが独立して動くため、資産とCIの紐づけがうまくいくかは確認が必要
　　　　　　（CIを特定できる項目がExcel内にあればそのままインポートすることで実現可能？）

②変換マップのスクリプト(OnAfter)を作成する
　→CIレコードの取り込みに合わせて資産レコードの作成or更新を行う

文字だけだとイメージしにくい箇所があるかもしれませんが、ご検討いただければと思います。